為培育真正理解日本的台灣年輕世代，以強化日台關係並促進台灣的日本研究，本協會特別重視自碩博士至博士後研究等對日本具深度理解且為擔當下一個世代的人才培育。促進台灣的日本研究其主體為台灣，日本方面則著重於從旁協助對人才培育有益的活動。
本協會優先支援的對象為設有日本研究學分學程、日本研究碩士課程或學位學程、以及成立日本研究機構等積極投入人才培育及其制度化之大學。
日本研究支援事業一覽表
1. 學術活動經費資助
2. 日本書籍中文翻譯及出版經費資助
3. 客座教授派遣事業
4. 撰寫碩博士論文訪日經費資助
5. 出席國際學術會議經費資助
6. 日本研究支援活動同窗研討會
7. 圖書寄贈
8. 2023年度日本國際交流基金會(The Japan Foundation)經費資助辦法
9. 日本研究研習營